UC彩票频道 【校庆进行时】国科大计算机与控制学院举办草地音乐节

  • 近年一个非常受关注的模型是中下地壳流模型。
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  2018-10-19日新闻讯:膜蛋白的结构和功能状态对环境影响敏感,细微的环境变量都可能造成膜蛋白结构和分子机制认识的偏差。在晶体环境中AqpZ的R189侧链的不同构象分布可能来自R189的不同功能状态或者环境因素偏差,因此在天然磷脂膜环境中,AqpZ蛋白的R189侧链门控分子机制值得探究和验证。

  中国科学院广州地球化学研究所矿物学与成矿学重点实验室的陈锰副研究员通过使用计算机模拟方法,系统分析了金属阳离子组成、层间阴离子类型和水含量等因素对水滑石超族矿物多型的影响。计算机模拟研究,一方面可以为实验分析的结果提供佐证,另一方面可以获取较之实验分析更为精细的结构认识。模拟研究揭示:层间离子为NO3-离子时,水含量的上升会使层堆垛多型由3R1向1T转变(图3)。多型转变与NO3-离子的构型转变耦合,NO3-离子由D3h向C2v对称性转变。当三价金属离子替代量更高时,多型转变出现于更低的水含量。而当层间离子为SO42-离子时(图3),水含量的上升造成三阶段的多型转变。第一和第三阶段的多型均为3R1多型,而中间阶段的多型与阳离子比例相关,为1T多型或出现随机混层现象。多型结构与SO42-离子结构耦合,中间阶段以出现较高比例的Cs构型SO42-离子为标志,而在其余情况,SO42-离子大多为C3v构型。使多型发生转变的水含量几乎与阳离子比例无关,这与层间为NO3-离子的情况不同。层间为CO32-离子或Cl-离子时,水含量的变化不会造成多型的改变,层结构始终为3R1多型。层间阴离子的构型反映了局域的氢键作用,而片层的堆垛会影响长程的静电作用。局域的氢键作用和长程的静电作用共同维系水滑石超族矿物的结构与稳定性。这为揭示该族矿物在地球化学环境中的稳定性提供了重要的结构认识。

  该研究阐释了lncRNA-ISG20调控流感病毒的作用靶点及其抑制流感病毒复制的分子机制,揭示lnc-ISG20作为一种新型干扰素诱导基因在宿主抗病毒天然免疫防御系统中的作用。两个研究组的博士研究生柴文佳和副研究员李晶为该论文第一作者,叶昕研究员为文章通讯作者。该研究得到国家重点研发计划项目及国家自然科学基金等资助。该项成果于2018年6月13日在国际重要学术期刊JournalofVirology上在线发表(JournalofVirology,2018;doi:doi:10.1128/JVI.00539-18)。

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  病原细菌通过三型分泌系统分泌许多效应子进入植物细胞内,操控植物细胞内的免疫信号传导以及其他多种细胞生物学过程(如干扰植物蛋白功能、操纵植物激素改变等),来帮助病原微生物致病。水稻白叶枯病菌的三型分泌系统效应子包括两大类:转录激活子样(transcriptionactivator-like/TAL)和非转录激活子样(non-TAL)效应子。TAL效应子通过自身的重复序列直接识别并结合靶基因启动子来调控宿主基因表达;然而对non-TAL效应子致病机理的了解却十分匮乏。

  该研究结果于2018年6月18日在ThePlantCell杂志在线发表(DOI:10.1105/tpc.18.00063)。中国科学院大学博士生导师,遗传与发育生物学研究所王永红研究员研究组博士研究生张宁、博士后余皓和李家洋研究组副研究员余泓为该论文的共同第一作者,王永红研究员为通讯作者。基因组分析平台的陈浩峰博士、澳大利亚塔斯马尼亚大学的StevenM.Smith教授参与此项研究。该研究得到了国家自然科学基金委重大研究计划、科技部973项目、中国科学院战略性先导科技专项等项目的资助。

  中国科学院大学博士生导师,微生物研究所刘宏伟研究组以藏灵芝为研究材料,从藏灵芝中分离提取到一结构新颖的三萜类化合物——GL22。研究结果显示,GL22可以显著抑制体外培养的肝癌细胞的增殖活性。进一步研究其作用机制的结果表明,GL22能显著抑制脂肪酸结合蛋白的表达和细胞内自由脂肪酸的转运,从而引起细胞线粒体特性脂质心磷脂稳态水平的下降,导致线粒体形态和功能异常,并最终引发肝癌细胞的死亡。值得注意的是,GL22虽能抑制肝癌细胞的裸鼠移植瘤的生长,却不对裸鼠产生明显的毒副作用,有效降低了“饿死”肿瘤细胞的同时对正常细胞生长的影响,在抗肝癌药物研发领域显示出极好的应用前景。该研究也进一步证实了藏灵芝的药用和经济价值。 图5典型关联分析(CanonicalCorrelationAnalysis)解释了造成蘑菇圈不同区域微生物群落差异的驱动因素

  Zn2+是生物体必须的微量元素,在多种生命活动中发挥重要的调控作用。目前的研究多集中于锌结合蛋白的调控上,Zn2+通过与转录因子、蛋白酶等蛋白因子结合,调节蛋白结构与活性进而影响其功能。同时,胞内游离的Zn2+作为信号分子的研究也偶有报道,但调节机制尚不清楚。胞质中游离Zn2+的缺失和过量都是有害的,其胞内平衡主要由两大家族蛋白:ZIP(SLC39,由胞外或者胞内Zn2+store向胞质转运Zn2+)和ZnT(SLC30,由胞质向胞外或胞内Zn2+store转运Zn2+)来调控。

  前期,课题组成员通过一系列的模拟实验研究,提出烃源岩/原油中的金刚烷主要来源于沥青的二次裂解;单、双金刚烷类化合物随热演化程度的增加均经历了由生成到富集再到裂解的演化阶段。在此基础之上,重新认识了不同金刚烷类指标构建的理论基础、演化特征以及适用范围,建立了基于金刚烷的成熟度判识指标体系:在金刚烷绝对含量较低(<100ppm)的情况下,传统生标更适合作为成熟度指标;金刚烷浓度比值指标适用于生油窗范围成熟度的判识;金刚烷异构化比值指标适用于原油裂解晚期成熟度的判识。而针对不同类型干酪根(I、IIA和III型)开展的热演化模拟实验表明金刚烷浓度比值指标虽然在生油窗范围可以指示成熟度相对高低,但是受有机质类型影响明显;金刚烷异构化比值指标受有机质类型影响不大,是比较理想的成熟度指标。 ”

  在本项研究工作中,研究人员首先通过化学位移分布以及偶极耦合常数测量证实AqpZ的R189侧链在磷脂膜环境只存在一种稳定的刚性状态,不具有大幅度的运动。然后通过CS-Rosetta手段计算出AqpZ在磷脂膜环境中的三维结构模型,发现R189侧链胍基和A117残基羰基形成稳定的H键,将R189侧链稳定在朝上“打开”状态。最后通过蛋白水分子交换常数测量,验证了R189侧链朝上“打开”分布的合理性。通过AqpZ的结构、动力学以及水分子交换常数分析,证实了AqpZ在功能活性状态下R189侧链朝上稳定分布,处于永久“开放”状态。这项工作提出了水通道蛋白研究中全新的门控分子机制,加深了水通道蛋白的认识,同时也强调了研究环境对膜蛋白分子机制研究的重要性。

  中国科学院广州地球化学研究所矿物学与成矿学重点实验室的陈锰副研究员通过使用计算机模拟方法,系统分析了金属阳离子组成、层间阴离子类型和水含量等因素对水滑石超族矿物多型的影响。计算机模拟研究,一方面可以为实验分析的结果提供佐证,另一方面可以获取较之实验分析更为精细的结构认识。模拟研究揭示:层间离子为NO3-离子时,水含量的上升会使层堆垛多型由3R1向1T转变(图3)。多型转变与NO3-离子的构型转变耦合,NO3-离子由D3h向C2v对称性转变。当三价金属离子替代量更高时,多型转变出现于更低的水含量。而当层间离子为SO42-离子时(图3),水含量的上升造成三阶段的多型转变。第一和第三阶段的多型均为3R1多型,而中间阶段的多型与阳离子比例相关,为1T多型或出现随机混层现象。多型结构与SO42-离子结构耦合,中间阶段以出现较高比例的Cs构型SO42-离子为标志,而在其余情况,SO42-离子大多为C3v构型。使多型发生转变的水含量几乎与阳离子比例无关,这与层间为NO3-离子的情况不同。层间为CO32-离子或Cl-离子时,水含量的变化不会造成多型的改变,层结构始终为3R1多型。层间阴离子的构型反映了局域的氢键作用,而片层的堆垛会影响长程的静电作用。局域的氢键作用和长程的静电作用共同维系水滑石超族矿物的结构与稳定性。这为揭示该族矿物在地球化学环境中的稳定性提供了重要的结构认识。

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